熊本地震から２カ月後の２０１６年６月、停滞した梅雨前線による大雨が被災地を襲い６人が亡くなった。地震で緩んだ地盤に雨が降って起きた土砂崩れに巻き込まれたとして、うち５人は地震犠牲者数に計上されている。